MPK adalah singkatan dari majelis perwakilan kelas dan kerja dari MPK adalah mengawasi dan mengevaluasi kinerja dari OSIS MPK SMA negeri 1 Magetan juga merupakan jembatan antara siswa dengan sekolah yaitu menampung aspirasi dari siswa untuk di saring dan disampaikan kepada pihak sekolah. MPK sendiri memiliki 4 program unggulan yang selalu di lakukan yaitu ada LPJB atau laporan pertanggungjawaban besar yang kedua ada menfess ma yang ketiga ada dialog terbuka dan rapat besar atau rabes. Sistem keanggotaan di MPK yaitu cuman ada INTI MPK dan MPK kelas, Dan MPK inti ini sering bekerja sama dan berkoordinasi dengan MPK kelas untuk memudahkan nantinya ketika mereka membutuhkan aspirasi atau keinginan siswa agar lebih cepat.
OSIS Inti adalah kelompok inti dari struktur organisasi OSIS yang bertanggung jawab penuh terhadap jalannya seluruh kegiatan OSIS di sekolah. Mereka menjadi penggerak utama, pengambil keputusan strategis, dan penghubung antara siswa, guru pembina, dan pihak sekolah.
Setiap pengurus BPH OSIS Inti juga bertugas menjadi role model (teladan) bagi siswa lainnya, menjunjung tinggi kedisiplinan, dan aktif menjalin komunikasi yang baik dengan pihak sekolah dan sesama siswa.
a. Melaksanakan peribadatan sesuai dengan ketentuan agama masing-masing
b. Menjalankan kegiatan peringatan hari besar keagamaan.
c. Membina toleransi kehidupan antar umat beragama di lingkungan sekolah.
d. Mengadakan program kerja yang bernuansa keagamaan sesuai dengan hari-hari besar keagamaan di atas.
e. Mengembangkan dan memberdayakan kegiatan keagamaan di lingkungan sekolah.
f. Memiliki anggota terdapat perwakilan 3 agama yakni, Islam, Kristen, dan Katholik.
g. Wajib berpartisipasi dalam ekstrakurikuler kerohanian.
h. Menaungi beberapa ekstrakurikuler Rohis (Rohani Islam), Rokris (Rohani Kristen), Rokha (Rohani Katolik), dan Nasyid.
i. Program kerja saat ini Isra' Mi'raj, Zakat, Pondok Ramadhan, Nuzulul Qur'an, Qurban, Maulid Nabi, Takbir Keliling, Natal, Paskah.
a. Mengadakan program kerja yang menunjang prestasi akademik siswa/i
b. Menaungi ekstrakurikuler KIR (Karya Ilmiah Remaja) dan ECC (English Conversation Club)
c. Program kerja saat ini SMASA Champion.
a. Menjadi petugas upacara saat hari-hari besar Nasional
b. Mempersiapkan dan melatih untuk petugas upacara setiap hari Senin
c. Wajib berpatisipasi dalam ekstrakurikuler DAP (Dewan Ambalan Penegak)
d. Mempelajari dan meneruskan nilai-nilai luhur, kepeloporan, dan semagat perjuangan para pahlawan.
e. Menjaga dan menghormati simbol-simbol dan lambang-lambang negara
f. Menaungi ekstrakurikuler Pramuka dan KOOPDERA
g. Program kerja saat ini SMASA FESTIVAL DAN Study Tour.
a. Menerapkan nilai budi pekerti luhur
b. Menyelenggarakan kegiatan dana sosial dan menggalakkan dana spontanitas apabila terdapat berita duka dari siswa/i sebagai wujud bela sungkawa.
c. Menaungi ekstrakurikuler PIK-R (Pusat Informasi dan Konseling Remaja).
d. Program kerja saat ini adalah Hari Buku.
a. Memanfaatkan peran teknologi informasi dan komunikasi.
b. Meningkatkan kreativitas dan keterampilan di bidang kewirausahaan.
c. Mengembangkan keahlian dalam bidang desain, edit dan dokumentasi setiap program kerja berlangsung.
d. Menaungi ekstrakurikuler DICOSMA (Digital Computer SMASA)
e. Program kerja saat ini Buku Kenangan, Foto Ijazah, Bazzar, Video Angkatan.
a. Melaksanakan latihan kepemimpinan untuk siswa SMA Negeri 1 Magetan.
b. Mewujudkan suasana yang demokratis di lingkungan sekolah.
c. Menaungi ekstrakurikuler PMR (Palang Merah Remaja)
d. Program kerja saat ini Kunjungan Industri, MPLS, LDKS, Training Organization.
a. Melestarikan nilai budaya yang sudah menjadi tradisi dengan tetap bersifat adaptif terhadap kemajuan zaman.
b. Membuat program kerja atau kegiatan yang dapat mengembangkan wawasan serta menerapkan nilai seni dan budaya di lingkungan sekolah.
c. Menaungi ekstrakurikuler Kridha Budaya, Band, Ariyan Choir, FOYA, Mahardika, Broadcast, Kuas.
a. Menyelenggarakan program kerja atau kegiatan guna mneingkatkan kesehatan jasmani.
b. Menaungi ekstrakurikuler Basket, Volly, Tenis, Badminton, dan Futsal.
c. Program kerja saat ini Classmeeting semester ganjil dan Classmeeting semester genap.